โรงเรียนบ้านเขตเมือง ตั้งอยู่หมู่ที่ ๑๐ ตำบลลาดใหญ่ อำเภอเมืองสมุทรสงคราม จังหวัดสมุทรสงคราม บุคคลที่ริเริ่มในการจัดตั้ง คือ นายสุนทร สว่างเกตุ นายจรัส สังขกุล นายตาด พุ่มพร โดยได้ขอที่ดินจากนายนพ นุชเรือน จำนวน ๓ ไร่ และขอจากนางขวัญเรือน นางเสงี่ยม หงวนประเสริฐ จำนวน ๑ ไร่ ๕๗ ตารางวาและเสนอจังหวัดขออนุมัติสร้างโรงเรียน โดยได้รับอนุมัติเปิดเรียนวันที่ ๑๗ พฤษภาคม พ.ศ.๒๕๑๕ใช้อาคารเรียนชั่วคราวที่คณะกรรมการดาเนินการก่อสร้าง โดยได้พัฒนาจากวัสดุของโรงเรียนบ้านคลองสองร่อง มีนายเจริญ ผ่องแผ้ว ดำรงตำแหน่ง ครูใหญ่ ตั้งแต่วันที่ ๑ เมษายน พ.ศ.๒๕๑๕ ต่อมาวันที่ ๑๙ สิงหาคม พ.ศ.๒๕๑๕ โรงเรียนได้จัดงานทอดผ้าป่าสามัคคีได้เงินจำนวน ๒๐,๐๐๐ บาท ซื้อที่ดินเพิ่มอีก ๑ ไร่ รวมเป็น๕ ไร่ ๕๗ ตารางวา และมอบโฉนดให้องค์การบริหารส่วนจังหวัด เก็บไว้ตามหนังสือเลขที่ ๑๙/๒๕๑๖ ลงวันที่ ๒๓ มีนาคม พ.ศ.๒๕๑๖ และในวันที่ ๑๗ สิงหาคม พ.ศ.๒๕๑๖ ฉลองอาคารเปิดเรียนเป็นอาคารแบบ ป.๑ข ๔ ห้องเรียน จานวน ๑ หลัง ปีงบประมาณ ๒๕๑๗ ได้รับงบประมาณ ต่อเติมห้องน้าห้องส้วม ใต้ถุนบ้านพักครู เป็นเงิน ๗,๕๐๐ บาท

วันที่ ๒๒ พฤษภาคม พ.ศ.๒๕๑๘ นายสุรินทร์ ทัศนศรี ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่

ในปี พ.ศ.๒๕๑๙ จังหวัดอนุญาตให้เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาตอนปลาย และได้รับงบประมาณต่อเติมห้องส้วม เป็นจำนวนเงิน ๒,๕๐๐ บาท สร้างบ้านพักครู ๑ หลัง เป็นเงิน ๕๐,๐๐ บาท สร้างอาคารเรียนแบบ ๐๑๕ สองชั้น ๔ ห้องเรียน จำนวน ๑ หลัง เป็นเงิน ๓๒๐,๐๐๐ บาท

ปี พ.ศ.๒๕๒๐ ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียน แบบ ๐๑๕ ตีฝ้าเพดาน รางน้า ทาทางเดินรอบอาคารเรียน เป็นเงิน ๗๕,๐๐๐ บาท

ต่อมาปี พ.ศ.๒๕๒๔ นายฑิฆัมพร วรกฤษณพงศ์ มารักษาการในตำแหน่งครูใหญ่ แทนนายสุรินทร์ ทัศนศรี ที่ไปศึกษาต่อ และได้รับงบประมาณสร้างโรงฝึกงาน ๑ หลัง กังหันลมผ้าใบ ๑ ชุด

ปี พ.ศ.๒๕๒๕ นายชุมพล อินทรคง รักษาการณ์ในตาแหน่งครูใหญ่แทนนายฑิฆัมพร วรกฤษพงศ์ ซึ่งเสียชีวิต

ปี พ.ศ.๒๕๒๖ นายสุรินทร์ ทัศนศรี กลับมาปฏิบัติหน้าที่ครูใหญ่และได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ที่โรงเรียนวัดสวนแก้ว นายสุนทร สว่างเกตุ ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่แทน และได้จัดตั้งกองทุนโรงเรียนบ้านเขตเมือง

วันที่ ๔ เมษายน พ.ศ.๒๕๒๘ นางธารี ชุณหะวัต ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ และได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดจันทร์เจริญสุข

วันที่ ๑ ธันวาคม พ.ศ.๒๕๓๐ นายอุดม อินทผล ผู้ช่วยอาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดสี่แยกราษฎร์บำรุงย้ายมาดารงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่โรงเรียนบ้านเขตเมือง

ปี พ.ศ.๒๕๓๑ สร้างสนามเด็กเล่นโดยได้รับงบประมาณ ๑๔,๐๐๐ บาท จากสโมสรไลอ้อนสตรี โดยมีนายประสงค์ เทพศิริ ผอ.ปจ.สมุทรสงคราม เป็นผู้รับมอบ เมื่อวันที่ ๑ ธันวาคม พ.ศ.๒๕๓๑ และได้รับงบประมาณจาก สปจ. เป็นจำนวนเงิน ๔๐,๐๐๐ บาท สำหรับสร้างส้วม ๑ หลัง ๔ ที่

วันที่ ๕ กุมภาพันธ์ พ.ศ.๒๕๓๓ โรงเรียนได้ติดตั้งไฟฟ้าขึ้น โดยจ่ายค่าขยายเขต เป็นเงิน ๕๓,๗๕๑ บาท ค่าอุปกรณ์ในอาคารเรียน ๒๐,๐๐๐ บาท ค่ามิเตอร์ ๑,๓๒๒ บาท ด้วยเงินบริจาคจากประชาชน

วันที่ ๒๑ กุมภาพันธ์ พ.ศ.๒๕๓๓ ได้ติดตั้งเครื่องสูบน้ำไฟฟ้า มูลค่า ๒๑,๐๐๐ บาท

วันที่ ๒๔ สิงหาคม พ.ศ.๒๕๓๔ สร้างซุ้มพระพุทธรูปประจำโรงเรียน ได้รับบริจาคจากห้องทองแสงเจริญตลาดแม่กลอง รับมอบซุ้มพระพุทธรูป ๕๐,๐๐๐ บาท และพระพุทธรูป ๕๖,๐๐๐ บาท รวมมูลค่า ๑๐๖,๐๐๐ บาท

วันที่ ๒ ตุลาคม พ.ศ.๒๕๓๔ สร้างถังน้ำฝน รพช. จำนวน ๔ ลูก โดยรับบริจาควัสดุจาก รพช.

วันที่ ๒๑ มกราคม พ.ศ.๒๕๓๕ ได้จัดสร้างถังเก็บน้าฝนแบบ รพช. ๔ ลูก จากการบริจาคของนายทองดี นางประสิทธิ์ อินทผล ๒,๐๐๐ บาท นายทวี นางจินดา สว่างวงศ์ ๒,๐๐๐ บาท นางทองอยู่ พุทธชาด ๑,๕๐๐บาท นายชิต ปานมา ๕๐๐ บาท คณะครูนักเรียน ๖๐๐ บาท

วันที่ ๒๘ กรกฎาคม พ.ศ.๒๕๓๖ จำหน่ายบ้านพักครู โดย สปอ.เมืองฯ มารื้อบ้านพักครู ๑ หลัง ตามหนังสือ ศธ.๑๔๖๖.๑๘๒๔ ลงวันที่ ๑๕ กรกฎาคม พ.ศ.๒๕๓๖ เพื่อ สปอ.เมืองฯ จะนำไปปลูกสร้างค่ายลูกเสือ ณ โรงเรียนวัดบางประจันต์

ปีงบประมาณ พ.ศ.๒๕๓๖ ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน แบบ สปช.๑๐๕/๒๙ รับงานและใช้งานเมื่อวันที่ ๙ มกราคม พ.ศ.๒๕๓๗

วันที่ ๑๖-๒๓ กรกฎาคม พ.ศ.๒๕๔๑ ได้จัดทำสนามเด็กเล่นหลังอาคารเรียนป.๑ข โดยใช้วัสดุท้องถิ่น

วันที่ ๓ สิงหาคม พ.ศ.๒๕๔๑ นายนพ นุชเรือน ได้มอบเงินจัดตั้งกองทุน “สอย นัด จรัส นพ นุชเรือน” รวมเป็นเงิน ๒๒๗,๗๔๙ บาท ให้เป็นกองทุนเพื่อการศึกษาของโรงเรียนบ้านเขตเมือง

เดือนพฤษภาคม พ.ศ.๒๕๔๒ ได้จัดสร้างเสาธงใหม่เพราะของเดิมผุ โดยผู้ใหญ่ประเทือง นาคทอง บริจาคเงิน ๒๐,๐๐๐ บาท และนายทอง มีประวัติ มอบเงิน ๘,๐๐๐ บาท สำหรับใช้ในการก่อสร้าง

วันที่ ๑๑ กรกฎาคม พ.ศ.๒๕๔๕ ได้รับมอบห้องน้ำ ๔ ห้อง พร้อมห้องอาบน้ำ ๑ ห้อง ที่ปัสสาวะชาย ๓ ที่ จากสโมสรโรตารี่สมุทรสงคราม เป็นจำนวนเงิน ๔๐,๐๐๐ บาท และคุณสมบูรณ์ คุณทองหยิบ แก้วชัยเจริญกิจ เป็นเงิน ๔๐,๐๐๐ บาท รวมค่าแรงและค่าวัสดุก่อสร้าง เป็นเงิน ๙๙,๗๘๒ บาท

ต่อมาในปี พ.ศ.๒๕๔๘ นางทรงศรี รชตะนันทน์ ผู้อำนวยการโรงเรียนวัดอมรวดี(อมรวิทยาคาร) ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการ แทนนายอุดม อินทผล ซึ่งย้ายไปเป็นผู้อำนวยการโรงเรียนอนุบาลสมุทรสงคราม

ในปี พ.ศ.๒๕๕๑ ได้ก่อสร้างหอประชุมลานธรรม ด้วยเงินบริจาค เป็นเงินทั้งสิ้น ๒๕๐,๐๐๐ บาท

ในปี พ.ศ.๒๕๕๒ นายอนันต์ มุกดาเวช ผู้อำนวยการโรงเรียนวัดนางพิมพ์ ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการ แทนนางทรงศรี รชตะนันทน์ ซึ่งปลดเกษียณอายุราชการ

ในปี พ.ศ.๒๕๕๒ ได้ก่อสร้างอาคารเรียนพักพยาบาลของนักเรียน ด้วยเงินบริจาคจากประชาชน เป็นเงินทั้งสิ้น ๑๑๓,๖๐๐ บาท

ในปี พ.ศ.๒๕๕๕ น.ส.นัคสวรรย์ ศรีจันทร์ ผู้อำนวยการโรงเรียนวัดบางประจันต์ ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อานวยการแทนนายอนันต์ มุกดาเวช ซึ่งปลดเกษียณอายุราชการ

ในปี พ.ศ.๒๕๕๖ ได้รับมอบอาคารน้ำดื่ม จากสำนักงานกรมทรัพยากรน้ำบาดาล

ในปี พ.ศ.๒๕๕๘ ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ สปช.๑๐๕/๒๙ ใช้งานได้เมื่อ ๒๐ มกราคม พ.ศ.๒๕๕๙

ในปี พ.ศ.๒๕๕๙ ได้ปูกระเบื้อง และกรงสแตนเลสรอบใต้อาคารแบบ สปช.๑๐๕/๒๙ ทั้งหลัง

งบประมาณจากชุมชน และองค์กรเอกชน ได้รับมอบอาคารอเนกประสงค์หลังคาโค้งจากองค์การบริหารส่วนจังหวัดสมุทรสงคราม ได้ปรับปรุงโรงอาหารโดยบริษัทโตโยต้าสมุทรสงคราม

ในปี พ.ศ.๒๕๖๒ ได้มีการปรับปรุงซ่อมแซม อาคารเรียนแบบ สปช.๑๐๕/๒๙ งบประมาณ ๓๐๐,๐๐๐ บาท งบจากสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรสงคราม กำหนดส่งมอบงานหรือให้งานแล้วเสร็จภายในวันที่ ๒๘ กุมภาพันธ์ พ.ศ.๒๕๖๒

ในวันที่ ๑ มีนาคม พ.ศ.๒๕๖๒ นางปัทมา คล้ำจีน ได้เดินทางมารับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านเขตเมืองแทน นางสาวนัคสวรรย์ ศรีจันทร์ ซึ่งย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดดาวโด่ง

ในวันที่ ๑ กุมภาพันธ์ พ.ศ.๒๕๖๔ นางปทุมพร สินสุข ได้เดินทางมารับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านเขตเมืองแทน นางปัทมา คล้ำจีน ซึ่งย้ายไปดารงตาแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสาธุชนาราม (สินประชานุกูล)